Enligt varningen, som gäller mellan klockan 05 och 14 på onsdagen, kan kraftigare stråk av regn förekomma, vilket kan ge 30 till 50 millimeter nederbörd, enligt SMHI.
Den kraftiga nederbörden kan dels leda till störningar i trafiken på grund av översvämmade vägar, dels en risk för att viadukter, källare och dagvattensystem översvämmas.
Redan under tisdagen varslade SMHI för att Eskilstuna skulle kunna komma att få kraftigt regn under den tidiga onsdagsmorgonen. Någon varning utfärdades dock inte.
Både då och nu råder det stor osäkerhet var de största mängderna regn kan komma att falla i varningsområdet, som omfattar delar av inre Svealand och nordligaste Östergötland.