Vid 03.30-tiden under natten till torsdag larmades polisen till Tempo i Malmköping.
Flera gärningsmän ska ha tagit sig in i butiken genom att krossa en glasruta.
Vittnen såg flera personer lämna butiken i en äldre vit bil.
- En polispatrull fick under natten nys på den här bilen. Den hittade man mitt ute i skogen omkring Strängnäs, säger Roland Lindkvist, länsvakthavande polisbefäl.
Polisen spårade med hjälp av hund i området och grep tre personer, 17, 18 och 20 år gamla, som förhördes under morgonen.
18- och 20-åringen anhölls efter förhör, medan 17-åringen försattes på fri fot.
Vad gärningsmännen eventuellt fick med sig vid inbrottet är ännu inte bekräftat. En teknisk undersökning har gjorts på platsen.