Framför allt ser man mycket allvarligt på att händelserna har inträffat i nära samband med skolmiljön.
Man anser också att skolan borde ha ifrågasatt och utrett omständigheterna runt den dömde lärarens beteende.
Man menar att skolan inte sett till situationens helhet och brustit i arbetet med särskilt stöd. Dessutom har skolans arbete med fallet inte dokumenterats.
Till kommunens stöd uppger Skolinspektionen att man efter att fallet uppdagades i mars vidtagit kraftfulla stödåtgärder.
Senast den 19 januari ska Strängnäs kommun lämna en redovisning över vilka åtgärder som tagts fram i samband med Skolinspektionens kritik.
Den dömde läraren dömdes av tingsrätten i juli till fem års fängelse och skadestånd – och hovrätten gjorde detsamma.
Fem års fängelse för grov våldtäkt mot barn och sexuellt utnyttjande av person i beroendeställning blev straffet.
Läraren ska också betala skadestånd på 230 000 kronor till flickan.