– Polisen kommer att delge henne misstanke om ringa misshandel, säger åklagare Klas Engdahl.
Enligt anmälan är det någon gång i februari som den anställda ska ha slagit barnet.
Utredningen ska göras skyndsamt och den misstänkta pedagogen ska förhöras inom kort.
– Det blir antingen den här veckan eller nästa, säger Klas Engdahl.
Enligt en förälder till barnet ska det handla om en örfil och pedagogen ska själv ha medgett handlingen.
Den misstänkta pedagogen jobbar fortfarande kvar men inte på samma avdelning som treåringen.
– Vi gjorde en bedömning att den här personen inte var till någon skada för barn därför lät vi personen jobba kvar, säger Anna Thörn som är ytterst ansvarig över förskolorna i Nyköpings kommun.
Enligt Anna Thörn gjordes bedömningen i samråd med föräldrarna till treåringen. Den bedömningen kan komma och ändras efter att polisen har förhört pedagogen.
– Vi avvaktar utfallet efter förhöret sedan agerar vi utifrån det, säger Anna Thörn.
Polisanmälan gjordes av en förälder till barnet. Föräldrarna är kritiska till att kommunen själv inte anmälde händelsen och kräver en handlingsplan för att det inte ska kunna hända igen.