Regionaltågen Stockholm-Eskilstuna-Arboga går i stort sett som normalt. Enstaka tåg går annan väg eller stannar inte i Flemingsberg. Flera av regionaltågen trafikerar inte sträckan Stockholm-Flemingsberg och omvänt. SJ hänvisar till SLs pendeltåg. SJ-biljetter kan användas på denna sträcka. Trafikverkets arbete pågår 28 september till 4 oktober och 12 till 18 oktober.
Snabbtågen från Stockholm till Malmö respektive Göteborg går med färre avgångar. All information om trafikförändringarna finns på sj.se/trafikinfo.