Händelsen utspelade sig på ett tåg mellan Eskilstuna och Strängnäs i slutet av mars. Den unge mannen satt i första klass utan att ha biljett för den exklusiviteten, och det uppstod bråk när tågmästaren bad honom flytta.
Tumultet polisanmäldes, och nu står 16-åringen åtalad för våld mot tjänsteman. Tonåringen från Strängnäs ska även få stå till svars för att ha stulit två mobiltelefoner vid olika tillfällen under maj månad.
Den åtalade nekar till samtliga anklagelser.