Klockan var 17.51 på måndagskvällen då polis och ambulans larmades till Brogatan i Torshälla.
Enligt polisens uppgifter ska flickorna på elsparkcykeln, båda två under 15 år, ha vinglat ut på vägen och därefter blivit påkörda.
– Föraren av bilen ska inte ha haft någon större chans att undvika olyckan, säger Mats Pettersson, polisens presstalesperson i region Öst.
Flickorna fördes med ambulans till Mälarsjukhuset men ska ha fått lindriga skador.
Föraren av bilen är inte misstänkt för något brott, däremot kommer någon av flickorna på elsparkcykeln bli misstänkt för trafikbrott, enligt polisen.