Samtliga döda och skadade är militärer. Den azerbajdzjanska åklagarmyndigheten avfärdar att yttre faktorer har orsakat olyckan.
"Flera scenarier undersöks, däribland försumlighet av piloten, ett tekniskt problem eller väderförhållanden" skriver åklagarmyndigheten i ett uttalande.
Helikopterns färdskrivare har bärgats från olycksplatsen.
Händelsen inträffar två veckor efter det att Azerbajdzjan och Armenien utkämpat de hårdaste striderna vid gränsen sedan kriget under förra året.