Ytterligare ett 50-tal personer skadades.
Explosionen inträffade i torsdags kväll när en brand bröt ut i ammunitionslagret som tillhör försvarsdepartementet. Ett videoklipp från händelsen visar hur en rökplym stiger från branden, och därefter en kraftig detonation.
Katastrofmyndigheten uppger att mer än 500 ton dynamit fanns i lagret, och att bråte från explosionen upphittades upp till två kilometer från platsen.
Vid ett blixtinkallat regeringssammanträde på fredagen sade presidenten Kasym-Zjomart Tokajev att landet har "systematiska problem" med sina ammunitionslager.
Flera liknande explosioner har inträffat i ammunitionslager i Kazakstan på senare år, däribland tre i en anläggning nära staden Arys.