Anledningen var misstankar om korruption och mygel.
Förändringen kom sedan både enskilda, oberoende organisationer och religiösa grupper pressat presidenten om en regeringsombildning efter flera korruptionsskandaler.
I måndags lät Chakwera samtliga 33 ministrar gå.
– Ta inte emot gåvor i utbyte mot tjänster och fördelar och genom att låta vissa bli bättre behandlade av era departement. Det är korruption, sade presidenten när den nya regeringen svors in.