Wilhelm Loeper blev matchhjälte med sitt avgörande 1-0-mål efter 44 minuter.
Helsingborg tog ledningen strax före halvtidsvilan, genom Wilhelm Loeper.
Helsingborg har åtta poäng och AFC Eskilstuna har fem poäng efter fyra omgångar.
Lördag 8 maj 13.00 spelar AFC Eskilstuna borta mot Landskrona.