Amin Al-Hamawi blev matchhjälte på tilläggstid med sitt avgörande 1-0-mål.
Målet kom först i matchens absoluta slutskede, i 90:e minuten när Amin Al-Hamawi framspelad av Ervin Gigovic gjorde 1-0 till Helsingborg.
Helsingborg har två segrar, en oavgjord och två förluster och 8-10 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan AFC Eskilstuna har en vinst och fyra förluster och 3-10 i målskillnad. Förlusten var AFC Eskilstunas fjärde uddamålsförlust.
För Helsingborg gör resultatet att man nu ligger på 14:e plats i tabellen, medan AFC Eskilstuna är på 13:e plats.
AFC Eskilstuna tar sig an Västerås SK i nästa match hemma onsdag 27 september 19.00.