Robin Dzabic stod för Landskronas avgörande mål på övertid.
AFC Eskilstuna har en oavgjord och fyra förluster och 3-8 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan Landskrona har två vinster, två oavgjorda och en förlust och 9-9 i målskillnad. Det här var AFC Eskilstunas sjätte uddamålsförlust den här säsongen.
Med fyra omgångar kvar är AFC Eskilstuna på 15:e plats i tabellen, och Landskrona är på femte plats.
I nästa match möter AFC Eskilstuna Brage borta på söndag 22 oktober 15.00.