Smedby AIS avgjorde matchen i andra halvlek, efter en mållös första.
Målgörare för Smedby AIS var Buster Blosse 2 och Hanad Abdirisaq Mohamed, medan Trosa Vagnhärads enda mål gjordes av Alexander Jacob.
Trosa Vagnhärad har två oavgjorda tre förluster på de senaste fem matcherna, medan Smedby AIS har tre vinster, en oavgjord och en förlust.
Det här betyder att Smedby AIS ligger på andra plats i tabellen, och Trosa Vagnhärad är på 13:e plats.
I nästa omgång har Trosa Vagnhärad Huddinge hemma på Häradsvallen, lördag 6 augusti 14.00.