Anledningen är att klubben anser att hatinläggen ökat sedan Elon Musk köpte den sociala medieplattformen.
Werder Bremen har mer än en halv miljon följare på sitt tyskspråkiga konto på X, som hette Twitter när klubben gick med 2008.
"Under en täckmantel för rätten att uttrycka sig har hatinlägg, avsky mot minoriteter, högerextremistiska inlägg och konspirationsteorier tillåtits att florera på X i en otrolig takt", skriver klubben i ett uttalande på engelska.
Den fyrfaldiga mästarklubben följer därmed Bundesligakollegan St Pauli som förra veckan beslutade att sluta posta inlägg på X av samma anledning som Bremen.