Astrid Larsson blev matchhjälte med sitt avgörande 1-0-mål efter 24 minuter.
Matchen var mållös till Eskilstuna tog ledningen i 24:e minuten, genom Astrid Larsson.
Sundsvalls DFF har fem förluster och 2-10 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan Eskilstuna har två vinster, två oavgjorda och en förlust och 6-4 i målskillnad.
För Eskilstuna gör resultatet att man nu ligger på femte plats i tabellen, medan Sundsvalls DFF är på 14:e och sista plats.
I nästa match möter Eskilstuna AIK borta på lördag 27 maj 13.00.