Filip Tronét stod för Västerås SK:s avgörande mål på stopptid.
Gästande Västerås SK gjorde första målet. Ibrahim Yalatif Diabaté gjorde målet på pass av Herman Magnusson, redan i 13:e minuten. I 55:e minuten nätade David Palomino på straff, och kvitterade för AFC Eskilstuna.
I den 80:e minuten fick AFC Eskilstuna Yagan Sasman utvisad, och fick spela med en man mindre sista tio minuterna.
Det matchavgörande målet kom på stopptid, när Filip Tronét slog till och gjorde 1-2 för Västerås SK framspelad av Frederic Nsabiyumva.
AFC Eskilstuna har en vinst och fyra förluster och 4-9 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan Västerås SK har två vinster och tre oavgjorda och 7-4 i målskillnad. Det här var AFC Eskilstunas femte uddamålsförlust den här säsongen.
AFC Eskilstunas nya tabellposition är 14:e plats, medan Västerås SK leder serien.
I nästa match möter AFC Eskilstuna Utsikten borta på måndag 2 oktober 19.00.