Elin Rombing stod för Eskilstuna Uniteds avgörande mål efter 67 minuter.
Eskilstuna United har två segrar, en oavgjord och två förluster på de senaste fem matcherna, medan IFK Kalmar har två vinster och och tre förluster.
För Eskilstuna United gör resultatet att laget nu ligger på femte plats i tabellen, medan IFK Kalmar är på elfte plats.
I nästa omgång har Eskilstuna United Piteå borta på LF Arena, söndag 8 maj 15.00.