Nabil Al-Kharraz stod för Jäder U:s avgörande mål efter 89 minuter.
Jäder U gjorde första målet. Galgo David Lieth slog till, redan i sjunde minuten.
Laget ökade ledningen till 2-0 i 39:e minuten, när San Sartip Salman fick träff.
Jäder U ökade ledningen till 3-0 på tilläggstid i första halvleken, ännu en gång genom Galgo David Lieth. Direkt efter pausen nätade William Kotilainen och reducerade åt Nykvarn U.
I 59:e minuten reducerade Nykvarn U på nytt genom Alexander Lundberg.
I den 75:e minuten kvitterade William Kotilainen för Nykvarn U.
Abdilaziz Ali Noor gav Jäder U ledningen i 78:e minuten.
Nykvarn U kvitterade till 4-4 bara sju minuter senare återigen genom Alexander Lundberg.
Fyra minuter senare var det Nabil Al-Kharraz som såg till att Jäder U tog ledningen.
Det här var Jäder U:s tredje uddamålsseger den här säsongen.
Det här betyder att Jäder U ligger kvar på tionde plats i tabellen, och Nykvarn U på fjärde plats.
I nästa omgång har Jäder U Nya Södertälje borta på Geneta Sportfält KG 1, lördag 29 juni 11.00. Nykvarn U spelar hemma mot Standard söndag 30 juni 11.00.