Boo FK:s mål gjordes av Adam Nilsson 2, William Hay, Linus Lenerius och Max Malick Fall, Viljans av Mattias Alias 2 och Antonius Alias 2.
Förlusten var Viljans fjärde uddamålsförlust.
För Boo FK gör resultatet att man nu ligger på femte plats i tabellen, medan Viljan är på nionde plats.
Fredag 9 juni 19.00 spelar Viljan hemma mot Trosa Vagnhärad.