Slutresultatet skrevs till 2-2 (0-0).
Första halvlek blev mållös, men direkt efter pausen slog Viktor Broström till och gav Malmköping U ledningen.
I 67:e minuten nätade Viktor Broström på nytt, och gjorde 2-0.
I den 71:a minuten reducerade Tony Leikas för Flen.
Och med sju minuter kvar att spela kvitterade Flen genom Azizbek Karlsson. Det fastställde slutresultatet till 2-2.
Malmköping U har två segrar, en oavgjord och två förluster på de senaste fem matcherna, medan Flen har två vinster, två oavgjorda och en förlust.
Det här betyder att Malmköping U ligger kvar på fjärde plats i tabellen, och Flen på tredje plats.
Nästa motstånd för Flen är Katrineholm U. Lagen möts tisdag 6 september 17.45 på Hammarvallen.