Selma Berggren blev matchhjälte med sitt avgörande 2-1-mål efter 56 minuter.
Mallbacken började bäst och gjorde 1-0 redan i matchupptakten. Efter bara fyra minuter slog Ida Hallstensson till. I 54:e minuten nätade Nicole Robertson, och kvitterade för Eskilstuna.
Med en dryg halvtimme kvar att spela fick Selma Berggren träff och avgjorde matchen.
Förlusten var Eskilstunas tredje uddamålsförlust.
För hemmalaget betyder resultatet fjärde plats i tabellen. Eskilstuna är på sjätte plats. Så sent som den 23 maj låg Mallbacken på åttonde plats i tabellen.
Nästa motstånd för Eskilstuna är ÖSK. Lagen möts torsdag 20 juni 19.00 på Tunavallen.