Det var den franska ligaorganisationen som beordrat PSG att betala Mbappé summan han krävt. När klubben så vände sig till det franska fotbollsförbundet med en begäran om att ompröva ordern gick man dock bet.
Begäran till förbundets verkställande kommitté lämnades in en dag för sent, enligt en AFP-källa nära fallet.
Klubben hade tio dagar på sig att överklaga ligans dom, som föll den 25 oktober.
En överklagandekommitté i den franska ligan har försökt att medla i det allt bittrare bråket mellan Real Madrids forward Mbappé, och klubben han lämnade tidigare i år.
Mbappé har krävt summan som han menar består av de sista tre månaderna av hans lön plus flera bonusar.
PSG å andra sidan hävdar att 25-åringen hade gått med på att avstå från summan.
Medan rättstvisten med den förra klubben pågår så utreds också Mbappé för en misstänkt våldtäkt efter sitt besök i Stockholm tidigare i oktober.