IFK Nyköping avgjorde matchen i andra halvlek, efter en mållös första.
Målen gjordes av Mustaf Shaer Mahamed och Francisco Thomsson, som gjorde ett mål var.
För IFK Nyköping gör resultatet att man nu ligger på fjärde plats i tabellen, medan Primavera är på sjätte plats.
Lördag 25 september 14.00 spelar Primavera hemma mot BK Sport.