Boråslaget hamnade i underläge när Pa Dibba prickade rätt för medelpadingarna i den första halvleken. Med timmen spelad kom ett kraftigt Eskilstunapräglat mål.
Tidigare Cityspelaren Simon Lundevall slog ett inlägg från höger. Prodell störtade mot bollen, vann en mot en-duellen med Sundsvalls mittback Marcus Danielson från Skogstorp och nickade in kvitteringen.
I 78:e minuten använde "Proddan" foten och krutade in gästernas andra mål.
– Det är de andra som ger mig lägena, säger han ödmjukt till TT.
Marcus Rohdén säkrade segern i slutskedet genom att sätta 1–3 på straff.
– Vi har vår fördelning av straffar förberedd, så jag tänkte inte på att jag skulle ta den. Fast ett hattrick hade ju varit kul, det har jag aldrig gjort i Allsvenskan, säger Viktor Prodell.
Med sex fullträffar i år ligger han delad tvåa i seriens skytteliga, ett mål bakom Hammarbys Erik Israelsson.