Love Lindström slog till på tilläggstid och blev matchhjälte med sitt 2-1-mål.
Gästerna Karlstad Fotboll tog ledningen strax före halvtidsvilan, genom Mohammed Lashkari. I 68:e minuten nätade Rwi Elias, och kvitterade för Syrianska Eskilstuna IF.
Det matchavgörande målet kom på stopptid, när Love Lindström slog till och gjorde 1-2 för Karlstad Fotboll.
Syrianska Eskilstuna IF har tre vinster och två förluster och 9-8 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan Karlstad Fotboll har två vinster och tre förluster och 6-6 i målskillnad.
Syrianska Eskilstuna IF ligger på tredje plats i tabellen efter matchen, medan Karlstad Fotboll ligger på sjätte plats.
I nästa omgång har Syrianska Eskilstuna IF Grums borta på NP3 Arena, söndag 21 maj 14.00.