Segern var Syrianska Eskilstuna IF:s sjunde på de senaste nio matcherna.
Syrianska Eskilstuna IF:s målskyttar var Robin Baysal och Johan Hanna, medan Alexander Falkenström gjorde målet för Eker Örebro.
Eker Örebro har två vinster, en oavgjord och två förluster på de senaste fem matcherna.
Det här betyder att Eker Örebro är kvar på femte plats, och Syrianska Eskilstuna IF stannar på andra plats, i tabellen.
Syrianska Eskilstuna IF tar sig an Hertzöga i nästa match hemma söndag 12 juni 17.00.