Bakom segern låg två mål av Yonathan Mulugheta.
Yonathan Mulugheta stod för Värmbols avgörande mål på övertid.
Värmbol började bäst och gjorde 0-1 redan i matchupptakten. Efter bara fem minuter slog Yonathan Mulugheta till.
På stopptid i första halvleken blev IF Ekers Daniel Forsberg utvisad. Det dröjde till den 73:e minuten innan Edis Hodzic kvitterade för IF Eker.
Det matchavgörande målet kom på övertid, när Yonathan Mulugheta ännu en gång slog till och gjorde 1-2 för Värmbol.
Det här var Värmbols tredje uddamålsseger.
Resultatet innebär att IF Eker ligger kvar på sjunde plats och Värmbol på nionde plats i tabellen.
Nästa motstånd för Värmbol är Eskilstuna City. Lagen möts lördag 17 juni 13.00 på Värmbols IP.