Första halvlek blev mållös, men efter pausen slog Hamza Ahmed till och gav Malmköping U ledningen.
I 53:e minuten slog Max Hård till, och gjorde 0-2. Det blev också matchens sista mål.
Stenkvista har två vinster, en oavgjord och två förluster och 10-10 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan Malmköping U har fyra vinster och en förlust och 16-8 i målskillnad.
Det här betyder att Stenkvista nu ligger på sjunde plats i tabellen, och Malmköping U är på sjätte plats. Noteras kan att Malmköping U sedan den 29 augusti har avancerat fyra placeringar i tabellen.
Nästa motstånd för Stenkvista är Nykvarn U. Lagen möts onsdag 25 september 20.00 på Nykvarns IP.